中國大陸科研團隊發明幽門螺桿菌單細胞精準診療技術
資料來源：中國經濟網
來文單位：台灣貿易中心青島代表處
更新日期：2022/07/09
6月22日，中國大陸科研人員依託原創的臨床單細胞拉曼藥敏快檢系統（CAST-R），建立了單個細菌細胞精度、「鑒定-藥敏-溯源」全流程一體化的H.pylori診療技術CAST-R-HP，具有快速病原鑒定、精確藥敏表型檢測、基於單細胞全基因組支撐耐藥機制研究與精準溯源等優勢。
據瞭解，科研團隊構建了15種臨床常見胃部共生菌的單細胞拉曼光譜（SCRS）參考資料庫，進而利用端到端的深度卷積神經網路（DCNN），將拉曼光譜特徵提取與分類模型訓練過程相融合，有效提升了基於SCRS的病原鑒定準確率。直接從臨床胃黏膜樣品出發，對幽門螺桿菌細胞進行識別和鑒定，準確率達98.5±0.27%。
研究人員建立了單細胞精度測定代謝抑制程度的幽門螺桿菌藥敏表型快檢技術。與臨床標準E-test法相比，17株幽門螺桿菌臨床分離株對左氧氟沙星、克拉黴素的藥敏檢測準確率分別為94%和100%。另外，針對7例患者胃黏膜組織樣本，通過48—72小時的重水飼喂和藥物孵育，無需分離培養，直接測定樣品中幽門螺桿菌細胞對於左氧氟沙星和克拉黴素的藥敏性，準確率均為100%。
針對耐藥機制研究和全基因組溯源，研究人員從臨床樣品中直接識別特定藥敏表型的幽門螺桿菌細胞，進而通過拉曼光鑷液滴單細胞分選（RAGE）晶片，完成高均衡性的目標單細胞分選和核酸擴增。拉曼分選後的單個幽門螺桿菌細胞，全基因組覆蓋度可達99.7%，通過基因型驗證了藥敏表型。
據介紹，下一步，研究人員將基於「微生物藥敏單細胞技術臨床示範網路」，進一步開發CAST-R-HP系統，拓展其應用，從而為建立單細胞精度的幽門螺桿菌診療與疾控體系奠定技術和裝備基礎。
資料來源：http://www.ce.cn/cysc/newmain/yc/jsxw/202206/23/t20220623_37785659.shtml